时间
动画集数
漫画话数
剧情
50年前
无
File.300
日本富豪“乌丸莲耶”以99岁高龄对外宣称过世。
47年前
无
File.1107
从父亲处继承代号的现黑衣组织二号人物朗姆（Rum）代替因身体原因未能出席的乌丸会长参加国际经济论坛年度会议。
30年前
495 红与黑的碰撞 昏睡
File.595
伊森·本堂加入CIA。
无
File.423
宫野厚司与宫野艾莲娜结婚。
无
File.1025
宫野厚司加入白鸠制药并着手开发药物。
无
File.1106
瑞秋·浅香（即若狭留美）的父亲在为美国资本家阿曼达·休斯担任贴身保镖时为阿曼达挡枪，从而殉职。
目击了开枪犯人的浅香拒绝了证人保护计划，被阿曼达收为养女。
27年前
495 红与黑的碰撞 昏睡
File.595
伊森·本堂来到日本进行谍报活动。
25年前
无
File.1025
白鸠制药倒闭，宫野厚司与妻子艾莲娜开了一家宫野诊所。
20年前
345 与黑衣组织的正面对决 满月之夜的双重谜案
File.433
黑衣组织杀手贝尔摩德（Vermouth）杀害了一直在调查组织的FBI探员茱蒂·斯泰琳的父亲，并放火烧茱蒂的家。
年幼的茱蒂幸免于难，并被她父亲的同事以“证人保护计划”保护起来。
茱蒂对当年Vermouth所说的“A secret makes a woman woman.”印象深刻。
286 工藤新一NY事件（事件篇）
File.350
女明星莎朗·温亚德（即Vermouth）和工藤有希子一起向魔术师黑羽盗一学习易容术并成为好友。
19年前
953 充满谜团的鸡尾酒（中篇）
File.1011
降谷零因受伤来到宫野夫妇经营的诊所。
宫野厚司犹疑着加入乌丸集团完成某研究，因为艾莲娜的姐姐（即玛丽·世良）认为该集团散发可疑的味道。后来知道艾莲娜怀上第二胎时后，决定重新考虑。
无
File.423
宫野夫妇进入黑衣组织，参与APTX-4869的研究。
18年前
无
File.179
File.425
宫野志保出生，其母艾莲娜暗中留下录音带后，宫野夫妇两人“意外死亡”。
17年前
1164-1167 17年前的真相
File.1106-1107
在警察厅警备局警备企划课任职的黑田兵卫佯装休假赴美观看国际象棋大赛，实则接到上司密令会见阿曼达·休斯，但未等正式会见，阿曼达即已身亡。
861-862 与17年前同样的现场1164-1167 17年前的真相
File.948File.1107-1108
黑衣组织前往羽田浩司所住的饭店抓捕瑞秋·浅香（Asaca）。阿曼达·休斯和“将棋4冠王”羽田浩司为保护浅香接连被迫服下“银色子弹”而身亡。
黑田兵卫则将见到两人遇害而崩溃的浅香打晕后带她逃离现场，但不幸遭遇车祸。导致黑田一只眼睛失明并昏迷数年，而浅香在独自逃离现场后则下落不明。
无
File.949File.972File.1037File.1109
赤井务武被羽田家的好友委托调查“羽田浩司事件”，然而遭遇黑衣组织，并将告别信寄给妻子玛丽，称自己“惹到了不得了的人”，此后便下落不明。
无
File.972
赤井秀一前往美国留学。
10年前
881-882 涟漪中的魔法师
File.972
赤井拿到美国国籍并找到一份兼职的工作，回到日本后与世良真纯首度见面，一旁的羽田秀吉则在寻找“玛丽妈妈”（玛丽·世良）。
玛丽质疑赤井至美国留学的动机（调查父亲务武遭遇事件的真相），亦对其欲加入FBI的决定感到相当不满。
玛丽提到务武“去世”前要其他人当作他从来没存在过，赤井则心想父亲的遗体尚未被人寻获。
世良想方设法逗弄赤井皆未成功，而新一对赤井身份错误的推理却意外使其大笑。
新一向众人自称是“福尔摩斯的弟子”，世良对此印象深刻。
File.974
玛丽从赤井的言行看到其父务武的身影，便认同其欲加入FBI的想法。
世良发现新一又成功使赤井大笑，便称其为“魔法师”。
5年前
497 红与黑的碰撞 觉醒
File.599
FBI探员赤井秀一化名诸星大与宫野明美相遇，并借此与宫野志保结识。
赤井开始卧底于黑衣组织，在组织内日渐崭露头角，被授予代号黑麦（Rye）。
4年前
491-504 红与黑的碰撞
File.595
File.604
卧底于黑衣组织的CIA探员伊桑·本堂殉职身亡。
836-837 关系不好的女子乐队
File.937
世良真纯在车站月台遇见正在执行组织任务的赤井秀一及苏格兰（Scotch），并获Scotch指导贝斯弹奏技巧，随后波本（Bourbon）也出现在月台。
866-867 背叛的舞台
File.957
组织卧底身份曝光的日本公安警察Scotch准备自杀，赤井上前阻止并表明自己FBI的身份以协助他脱逃。
此时，楼梯间传出脚步声，Scotch为湮灭手机资料与自保，在其他组织成员抵达前开枪自杀。
赤井得知Scotch开枪自杀的目的，便将现场制造成是他枪杀Scotch。
File.956
波本（Bourbon）看见赤井拿着手枪站在已身亡的Scotch面前，检查现场后认为Scotch是因赤井逼迫而自杀，因此开始痛恨赤井。
3年前
无
File.1049
Vermouth开始假扮务武出现在伦敦沃克斯霍尔桥附近，引起军情六处的注意。
无
File.771
File.1049
玛丽从军情六处得知务武在伦敦出现后，便带上世良前住英国。
无
File.1114
大冈前首相的孙女大冈红叶乘坐祖父的专车到一新建别墅，并躲在厨房地板下的收纳柜，一伙歹徒因此误以为前首相来到别墅，准备发动袭击。
日本公安警察伊织无我在别墅制服来袭歹徒后，于厨房地下收纳柜歇息期间遇见红叶，红叶随后帮伊织处理伤口。
歹徒回到厨房准备袭击红叶，被伊织击退后其中一人逃跑。
2年前
307-308 残留下来的无声证言
File.380
龙舌兰（Tequila）找到板仓卓，命令他开发一种系统软件，但遭到拒绝，黑衣组织之后不断骚扰板仓卓，最终迫使他就范。
无
File.599File.1066
赤井在捕获琴酒（Gin）的行动中因卡迈尔的失误导致行动失败，并在假扮老人的朗姆（Rum）面前身份暴露，最终被迫离开组织。
无
File.1066
Rum向柯恩（Korn）发送赤井和卡迈尔的邮件照片，说他们是FBI，如果看见便直接射杀。
1年前
无
File.179
宫野志保结束美国留学，回到日本继续APTX-4869的研究。
286-288 工藤新一的纽约事件
File.350
工藤新一和毛利兰到纽约游玩，有希子招待他们，在剧院门口两人遇见并认识莎朗·温亚德。
File.351
在歌剧开演前，莎朗借口有事（假扮成银发杀人魔以吸引赤井秀一）先离开。（Vermouth认为伪装成一般的连续杀人魔可以降低赤井的警戒心）
File.354
剧院的杀人案件解决后，小兰在路上先是遇见了正在追捕银发杀人魔的赤井秀一，又在废弃仓库里遇见逃亡中受伤的银发杀人魔（Vermouth假扮）。
银发杀人魔在想将两人灭口时因栏杆断裂而从高处掉落，被小兰和新一所救。
事后，银发杀人魔被发现自杀，但现场所有的痕迹都被抹去。（实际为Vermouth所杀）
莎朗托有希子转告给小兰一句话：“你说的没错，我发现身边似乎也有个天使。”
无
File.433
莎朗假造自己的死亡，以女儿克莉丝·温亚德的假身份继续生活下去。
现在
1 云霄飞车杀人事件
File.1
新一和小兰去游乐场玩时无意间目睹神秘黑衣人的地下交易，Gin、伏特加（Vodka）发现后强行灌下最新研发的APTX-4869。
2 董事长千金绑架事件
File.2
新一发现身体缩小后将此事告知阿笠博士，决定隐藏身份，并化名江户川柯南，寄居于毛利侦探事务所。
4 大都会暗号地图事件
File.36-39
柯南转入帝丹小学，成为少年侦探团一员。
5 新干线大爆破事件
52 雾天狗传说杀人事件
File.33-35
漫画中柯南借由窃听得知Gin和Vodka的代号。
（动画中改为雾天狗杀人事件片头）
43 江户川柯南诱拐事件
File.49-51
工藤夫妇得知柯南的真实身份。
48-49 外交官杀人事件
File.92-96
服部平次登场，柯南喝下白干意外恢复工藤新一之身。
54 电玩公司杀人事件
File.114-116
柯南偶遇黑衣组织的成员Tequila，但其被意外炸死。
57-58 福尔摩斯迷杀人事件
File.121
服部平次得知柯南的真实身份。
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
File.179
宫野志保查看APTX-4869的服药名单时发现，所有服药者皆显示“死亡”，但只有工藤新一是显示“不明”。
组织于一个月内二度潜入工藤宅邸内调查，未发现居住的人为痕迹，但宫野志保发觉其童年时期的服装全部遗失。
二度调查未果后，宫野志保将工藤新一的状态改为“死亡”。
340-341 隐藏在厕所中的秘密
File.425
宫野明美将母亲艾莲娜生前留给灰原的录音带藏在出岛设计事务所的厕所内。
495 红与黑的碰撞 昏睡
File.599
宫野明美在抢劫银行的前夜向赤井传送简讯。
128 黑暗组织十亿元抢劫事件
File.13-16
宫野明美化名广田雅美并完成抢劫十亿日元的任务，却被Gin杀害，弥留之际向到场救援的柯南说出关于组织的事。
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
File.179
宫野志保得知姐姐宫野明美的死讯后，因擅自中止药物研究被组织监禁。
宫野志保准备服药自杀却意外变小，于是逃离组织并寄住阿笠博士家，并化名灰原哀。
File.176
灰原转入帝丹小学。
File.178
灰原向柯南表明自己的组织代号为雪莉（Sherry），研发药物的名称为APTX-4869，
File.179
灰原因调查工藤宅邸时发现到的现象感到有兴趣，私自改写服药名单的资料。
灰原也提到自己背叛的原因除了组织擅自使用尚在试验性阶段的APTX-4869外，最大的原因为姐姐的死亡。
柯南欲得知APTX-4869的相关资讯，前往大学教授广田正巳的居所调查，却发现广田的遗体。
File.181
案件解决后，灰原告知柯南“广田雅美”为宫野明美的化名[8]，柯南得知此事后，对十亿元抢案时未能成功搭救明美而感到相当懊悔。
柯南成功获得APTX-4869的资料，却被电脑病毒“暗黑男爵”全部销毁。
130-131 竞技场一视同仁胁迫事件
File.189
灰原提到组织在半世纪前就已经开始策划某个大计划。
File.191
柯南为要赶在时限内找出犯人而着急，灰原说：“人是不能违逆时光的洪流的，若是勉强改变，人类是会得到惩罚的。”
170-171 黑暗中的死角
File.234-237
新出智明的父亲被继母所设的机关杀害，在柯南的协助下破案。柯南建议继母写出假的犯案手法以保护无辜的帮佣。新出智明在门外知道事件的真相。
176-178 与黑暗组织再次重逢
File.238
柯南和灰原在街上偶然看见Gin的保时捷356A，意欲跟踪时，却被Gin发现追踪器并将其销毁，但柯南依然得知组织成员皮斯可（Pisco）将在杯户饭店进行暗杀行动。
File.239
柯南和灰原赶到杯户饭店，Gin将Sherry在跟踪自己的事通知Pisco，并告诉他Sherry必定也会去杯户饭店。
Gin与Pisco通话时提到“残废的名侦探”。
File.240
Pisco暗杀成功后发现灰原，将她迷昏后关在饭店酒窖里。
File.241
灰原与柯南取得联系后提到APTX-4869的命名来源[9]，组织人员将还在研发阶段的此药物称为“残废的名侦探”。
灰原欲将组织电脑内有关APTX-4869的资料存进MO。
柯南让灰原喝下白干后，灰原恢复身体，从烟囱逃至饭店顶楼，而Gin和Vodka早已在顶楼埋伏。
File.242
灰原在Gin的拷问下拒绝说出离开组织后的行动，身中数枪。
柯南赶到后用麻醉枪击中Gin，同时灰原由烟囱逃回酒窖，而Gin用枪朝自己中针处开一枪以保持清醒。
Pisco露出真面目时，灰原因白干效力已过，身体变回小孩模样。
Pisco提到宫野夫妇的事并准备处决灰原时，柯南再次赶到解救。
Gin因Pisco在暗杀中出现重大失误而将其灭口。
案件结束后，灰原说存有药物信息的MO已经被烧毁。（实际上仍放在上衣口袋里面）
柯南不解为何Gin能够借由一根褐发就联想到宫野志保。
克莉丝·温雅德（Vermouth）搭上Gin的车，决定息影暂时在日本定居，并说：“我还有些很在意的事要调查…”。
345 与黑暗组织直面对决 满月之夜的双重谜案
File.433
长大的茱蒂加入FBI，追查Vermouth来到日本，化名茱蒂·圣提米利翁，并以帝丹高中英语老师的身份潜伏下来。
188 危命的复活 洞窟中的侦探团
File.251
小兰提到新出医生已经成为帝丹高中的校医。
灰原的桌上有一张带血的MO。
190 危命的复活 第三个选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
File.254-258
由于小兰疑似已得知柯南的真实身份，灰原提议柯南服用APTX-4869的解药试验品以回复真身，自己则假扮成柯南。
新一的同学提到有新来的英语老师，是个身材很好的外国人（茱蒂）。
345 与黑暗组织直面对决 满月之夜的双重谜案
File.433
Vermouth制造车祸企图害死新出智明一家，但新出一家事先被FBI暗中保护下来。
Vermouth开始假冒新出的身份。
File.433
File.500
FBI发现女明星克莉丝·温雅德及女主播水无怜奈经常出入新出诊所，便开始派人跟踪调查。
File.433
茱蒂潜入新出的房间，发现标靶上的照片后复制下来，由于灰原与照片中的人物相似，因此FBI猜测她就是Vermouth的目标。
Vermouth得知FBI曾潜入房间，并借此调查FBI的底细。
226-227 战斗游戏的陷阱
File.270
茱蒂首次登场并与柯南相识。
File.271
茱蒂暗中观察柯南协助警方查案。
File.272
茱蒂表示她曾在帝丹高中学园祭时见过新一，并称呼柯南为“Cool Guy”。（茱蒂以Vermouth照片上的标记称呼柯南）
茱蒂与某人（FBI的同伙）通电话，声称发现到的其中一个目标物已改变外表还开始上学（Vermouth假扮的新出医生），并将目标物取名为“Rotten Apple（腐烂的苹果）”。
230-231 神秘乘客
File.287
Gin问Vermouth是否已找到要找的东西，Vermouth回答尚未找到“本尊”（即宫野志保）。（由两人对话可得知Gin并不了解Vermouth的行动内容）
少年侦探团和博士一行人搭巴士去滑雪，灰原提到去杯户饭店阻止Pisco的暗杀行动时，感觉还有其他的组织成员在追思会现场。
此时，茱蒂和新出医生（Vermouth假扮）也搭上巴士，茱蒂改称柯南为“Cool Kid”。
光彦提到新出有去帝丹小学帮忙做身体检查，柯南说当天灰原刚好请假。（Vermouth借此得知柯南的真实身份为工藤新一）
赤井秀一首次登场并坐在巴士的最后一排，这时灰原感觉车上有组织的成员变得非常害怕。
巴士被强盗劫持，茱蒂绊倒歹徒，并借机启动歹徒手中的托卡列夫的安全装置。
File.288
柯南欲检查滑雪袋的内容物，被强盗发现，此时新出跳出来维护柯南。
柯南透过灰原的表情得知车上亦有组织的成员。
Vermouth看见柯南传给茱蒂的信息，暗中称柯南为“Cool Guy”。
File.289
茱蒂对歹徒说出“A secret makes a woman woman.”
灰原留在快爆炸的巴士上想一死了之，最后被柯南所救。
事后，赤井与人通话，说：“‘目标’尚未现身，改天再重新调查。”
233-234 无法消失的证据
File.290
柯南提到高木刑警有向他说“巴士劫持事件”中的乘客并没有身份不明的可疑人物，他认为巴士上会有组织的成员是纯属巧合，并未发觉灰原的存在。
242 元太的灾难
File.304
灰原提到Gin是左撇子。
253-254 总局刑警恋爱物语4
File.329
小兰至厕所找柯南时与赤井擦肩而过，小兰似乎对其有印象。
File.330
新出医生（Vermouth假扮）得知柯南可以利用变声器假扮别人。
柯南发现新出的演技很出色。
258-259 来自芝加哥的男人
File.325
詹姆斯·布莱克首次登场并与少年侦探团和博士结识。
詹姆斯问博士是否有见到一个留长发的男子（即赤井秀一）。
詹姆斯称自己是在伦敦的贝克街出生，于卡彭所在的芝加哥长大，灰原对此有特殊感觉，柯南则不以为然。
File.326
赤井开着雪佛兰经过少年侦探团旁边，灰原突然感到一阵恐惧。
File.327
詹姆斯发现柯南的不一般，称呼柯南为“Cool Guy”。
詹姆斯在警方作笔录前被赤井接走，灰原仍认为她很可疑。
柯南很在意詹姆斯的名字，他会联想到“Professor James Moriarty”，但可能因为自己是福尔摩斯迷的缘故。
事后，由詹姆斯与赤井的对话可得知赤井将之前留的长发剪掉，并打算让甩掉他的“恋人”（即Gin）后悔一辈子。
269-270 犯罪的纪念品
File.336
高木提到警视厅与毛利小五郎相关的案卷在“巴士劫持事件”当天被人偷走，后又被完整送回。
File.337
赤井暗中监视毛利侦探事务所。
271-272 情急之下的应变之道
File.339
茱蒂在谈话中提到FBI。
File.340
案件解决后，茱蒂与小兰和柯南离别时心想：“采收苹果的时刻差不多到了吧？”
Vermouth发邮件给Gin，提到雪莉酒，并且向宫野志保被打叉的照片发飞镖，旁边还有柯南和兰的照片。
274-275 幽灵鬼屋的真相
File.355
新出医生（Vermouth假扮）谎称家人皆已搬至青森老家，自己则在为父亲的命案出庭作证做准备。
277-278 英文老师vs关西名侦探
File.341
案卷的丢失让柯南很不安，他基本肯定克莉丝是组织的成员，并进一步怀疑“茱蒂=克莉丝”，刚巧赶来的服部对此很感兴趣，于是鼓动柯南去茱蒂住的公寓试探，在双方接触过程中发生命案。
File.343
案子虽然解决，但是对茱蒂的试探未果。
另外，柯南表示除茱蒂外还有两个可疑人物（即赤井和新出）。
最后，茱蒂浴室的镜子后面出现柯南和小兰的照片，并且照片上的字迹和Vermouth的一模一样。
284-285 中华街的雨中幻影
286-288 工藤新一的纽约事件
File.347-354
小兰回忆起她和新一去纽约玩发生的事。
小兰清醒后，开始怀疑当时在废弃仓库街遇到的长发男子（即赤井秀一）是FBI的一员。
289-290 光彦森林迷失记
File.360
灰原提到沼渊己一郎曾是组织成员一事。
无
File.380
板仓卓完成系统软件并尝试询问组织成员的身份及目的何在，对方（即Vermouth）回答：
“We can be both of God and the Devil. Since we're trying to raise the dead against the stream of time.”
307-308 残留下来的无声证言
File.377
小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓，从委托人的谈话中柯南了解到他就是在“电玩公司杀人事件”中被意外炸死的组织成员Tequila所接触的对象。
File.379
通过追查案件，柯南获得有关组织的线索——板仓的日记。
案件解决后，柯南和小兰在街上遇到赤井秀一。
309-311 接触黑色组织
File.380
赤井看着小兰的哭脸提到一个和她很像的女人（即宫野明美），柯南也借此了解小兰和赤井曾相遇过，并得知赤井的真实身份可能为FBI。
柯南透过日记中得知黑衣组织的庞大计划甚至影响到人类的前途，要使时光倒流。
File.381
柯南得知黑衣组织的行踪，并试图冒充板仓与Vodka接头。
File.383
柯南的诡计被Gin识破而失败，险些被Gin抓到。
最后柯南和灰原离开时，“恰巧”被赤井看到，灰原对此也有所感觉。
312-313 染上夕阳的布偶
File.384
灰原提到父亲宫野厚司相当出名，被称为“被学术界放逐的疯狂科学家”。
灰原称其在组织内研发的药为“使死者复苏的秘药”，但灰原也说她的主要研究目标并非如此。
329-330 用钱买不到的友情
File.398
阿笠博士认为灰原父亲宫野厚司的性格很随和，而母亲艾莲娜总是沉默寡言，是一个英国留学生。
335-336 东都显象所的秘密
File.417
柯南和灰原都感觉到自己被人跟踪。
File.419
跟踪者（FBI）最后被迫放弃。
赤井对着灰原的照片说“真是太像了！”（暗示他和灰原以前就曾相识）
338-339 四台保时捷
File.420
灰原患感冒，送医途中遇到命案，遇到小兰、园子和茱蒂，赤井也跟踪而来。
File.422
博士借茱蒂的车将灰原送回家，并找新出医生（Vermouth假扮）来看病。（Vermouth借机在博士家安装窃听器，并借此得知灰原的真实身份为宫野志保）
Vermouth将灰原的照片烧毁，表明已发现灰原下落。
340-341 隐藏在厕所中的秘密
File.423
博士带柯南和灰原去拜访宫野厚司的生前好友——设计师出岛社平，试图了解更多关于灰原父亲的事。
设计所的设计师提到宫野明美前阵子有回来“借厕所”，柯南和灰原认为一定有在厕所藏某样东西。
File.424
灰原提到母亲宫野艾莲娜在组织内被称为“Hell Angel”。
File.425
柯南在破案的同时，也找到宫野艾莲娜生前留给灰原，由宫野明美设法藏在设计所的录音带。
Vermouth打电话找组织成员卡尔瓦多斯（Calvados）来帮忙，正策划着某项行动。
343-344 便利商店的陷阱
File.426
茱蒂辞去帝丹高中老师的职务。
File.427
灰原听母亲艾莲娜遗留下来的录音带，其中似乎提到一段惊人的事情。
702 漆黑的神秘列车（隧道）
File.821
宫野艾莲娜在录音带中提到她在制作令组织实验室的伙伴都雀跃不已的梦幻灵药，而他们夫妇则另外称呼它为“Silver Bullet（银色子弹）”。
343-344 便利商店的陷阱
File.428
柯南以新一的声音打电话问小兰这阵子是否有到他家打扫（表示有人住过的迹象），兰否定这个问题。（其实是有希子担心柯南的安危而一直躲在工藤宅邸内）
小兰和园子到茱蒂家中开聚会时，意外发现镜子背后的照片。
345 与黑衣组织的正面对决 满月之夜的双重谜案
File.429
Vermouth利用幽灵船活动，邀请小五郎、新一和Gin，试图调开柯南而刺杀灰原。
柯南透过信件内容推测Vermouth已经得知他与灰原的真实身份。
Gin提到Vermouth是“秘密主义者”，亦是Boss的意中人。
File.433
File.434
柯南邀请服部化妆成工藤新一赴会，而自己在母亲有希子的帮助下化妆成灰原试图和黑衣组织接触。
File.435
兰因想了解茱蒂的真正身份，躲进茱蒂汽车的后备箱里。
File.431
茱蒂得知此计划，抢先一步接走灰原并试图将Vermouth引入陷阱，但Vermouth将计就计跟上前往。
File.432
茱蒂借由新出智明父亲命案真相及案卷的差异，揭发Vermouth假扮新出医生的事实。
File.433
茱蒂怀疑灰原与相片中的女性（宫野志保）是否为同一人，也不解Vermouth将柯南和兰的相片上分别写“Cool Guy”、“Angel”的意涵为何。
茱蒂借由指纹比对得知莎朗·温亚德和克莉丝·温亚德为同一人，并质问Vermouth为何“不会变老”。
灰原不放心柯南去，利用“犯人追踪眼镜”跟踪前往。
File.434
Gin提到他从不去记被他杀掉的人的长相及姓名。
有希子怀疑Vermouth先调离柯南再杀灰原的真正理由。
Vermouth认为宫野夫妇所做的研究相当愚蠢。
兰在最后关头从汽车后备箱跳出来拯救灰原，Vermouth不愿向兰开枪并叫她“Angel”。
Vermouth成功逃脱赤井的追捕，Calvados因双腿被赤井用骨折导致无法逃离现场而选择自杀。
赤井提到自己现在还不能和褐发女孩（即灰原）见面。
最后，Vermouth给Boss发邮件时的按键音被柯南听到，并声称自己已放弃追击灰原。
Vermouth向Gin隐瞒柯南和灰原的事，并提到Boss曾称赤井为“银色子弹”，Gin对此相当不屑。
Vermouth认为柯南正是她期盼已久的“银色子弹”。
346-347 找寻臀部上的印记
File.435
茱蒂、柯南、灰原等人统一对日本警方的口径，称这起事件是拐卖儿童引发的枪击事件，茱蒂在小兰和园子探望时，也用同样的说辞消除她们的疑虑。
File.437
灰原拒绝茱蒂加入“证人保护计划”的邀请。
361-362 帝丹高中校园灵异事件
File.457
真正的新出医生回归。
File.459
新出询问茱蒂：“假扮我的人（Vermouth）真的是坏人吗？”
371-372 沉默的航线
File.464
柯南看见犯人打电话的样子时突然回想起Vermouth的样貌。
374-375 星星与香烟的暗号
File.466
柯南调查上一事件犯人所打的电话，博士猜测可能是在鸟取县仓吉经营旅馆的某退休职棒选手，灰原一听到“仓吉”二字就有特殊反应。
File.469
山村操给他祖母发信息时，开头按键音和Boss的邮件地址很像，是鸟取县的号码。
385-387 斯特拉迪瓦里琴不协调的和音
File.474
柯南等人造访一音乐世家，得知Vermouth发邮件给那位先生时所发出的按键音旋律为童谣《七个孩子》。
394-396 诡异宅院大冒险
File.475
柯南由按键音的旋律推理出黑衣组织Boss的邮箱地址为“#969#6261”[10]，灰原称那组号码是“绝对不能开启的潘多拉宝盒”。
425 黑色冲击！组织之手逼近的瞬间
File.499
女主播水无怜奈首次登场，并委托小五郎协助调查“门铃怪客”。
柯南的窃听器及发信器意外被黏在水无的鞋底。
File.500
柯南借由窃听器得知水无为组织成员基尔（Kir），将与Gin、Vodka、Vermouth、香缇（Chianti）、柯恩（Korn）进行暗杀计划。
柯南巧遇茱蒂，茱蒂说FBI发现水无在Vermouth假扮新出后经常出入新出诊所，便开始派人跟踪，但刚才跟丢了。
File.501
Chianti提到Vermouth深受Boss喜爱。
File.502
由于下雨，Gin下令至一处集合，准备执行另一作战计划。
水无的高跟鞋意外脱落，柯南欲借机取回窃听器及发信器，却被水无发现，于是水无对柯南测谎。
柯南得知詹姆斯是FBI，也是茱蒂的上司。
茱蒂和詹姆斯表示赤井在得知组织的暗杀计划后就不明去向。
File.504
赤井事先在离毛利侦探事务所700码的高楼屋顶埋伏。
File.503
Vermouth敲着机车上的仪表板刺探水无：“Kir，你该不会是这个（Knock，意指NOC）吧？”
FBI欲夹击Vermouth却发生车祸，意外发现被夹击的机车骑士是水无而非Vermouth。
Gin发现柯南的窃听器及发信器，在取得Boss的同意后，决定将目标转移至毛利侦探事务所。
File.504
Gin质疑小五郎与Sherry的关系，因为窃听器及发信器的款式过于类似。
赤井成功狙击Gin及其手中的窃听器，并称Gin为“我可爱的‘恋人’”。
Gin认为小五郎与此行动并非毫无关系。
水无因意外受重伤导致昏迷不醒，FBI将其送进杯户中央医院。
柯南利用“蝴蝶结变声器”替水无向电视台请长假。（FBI并不知道柯南会“变声”）
427-428 超秘密上学之路
File.507
小兰提到班上刚转来一个长的很像水无伶奈的男孩子。
429-430 回不去的两人
File.508
本堂瑛祐首次登场。
446-447 被封死的窗户
File.532
柯南得知案件真相，因察觉到瑛祐在暗中观察他，而不使用“手表型麻醉枪”与“蝴蝶结变声器”进行推理。
无
File.553
Vermouth询问目击水无出事的小孩是否有目睹事故发生。
462-465 黑衣组织之影
File.550
茱蒂发现水无的过去背景全是捏造的。
瑛祐为确认目击者的证言，做出与水无相同的动作。
File.551
柯南根据瑛祐的测谎动作，推估他与水无伶奈有某种关联。
柯南在推理出案件真相的同时，发现瑛祐正捶著桥上的栏杆。
File.552
案件解决后，柯南透过瑛祐的言行确认他正在打听有关水无伶奈的消息。
File.553
Gin提到Kir（水无）曾在绝境下反杀卧底在组织里的“老鼠”，但Gin早已忘记长相及名字，只得知他拥有多重身份，并非简单人物。
Gin也表示自己已锁定目标，现在正进行刺探的阶段。
瑛祐发现一桩有趣的案子希望小五郎可以前去调查，地点正在水无发生车祸的现场附近，引起柯南的警觉。
柯南得知有穿黑衣的外国女人（即Vermouth）曾问过被害人的儿子一些问题，并注意到他正是目击水无出事的小孩。
File.555
Gin想起曾卧底在组织的“老鼠”叫做本堂。
466-467 坚不可摧的雪人
File.556
柯南向灰原提到水无受重伤住院的事情已经被黑衣组织发现，他已经将此事通知FBI。
柯南认为瑛祐应该不是黑衣组织的同伙，因为他曾看见瑛祐捶著桥上的栏杆，一脸不甘心的哭着。
479 与服部平次共度的3天
File.559
柯南在水无伶奈的粉丝网站上发现一张照片是以通天阁为背景且出现相貌酷似水无的女子，于是请服部在大阪协助调查。
484-485 黑色照片的下落
File.582
园子提到瑛祐最近一下课就不见踪影。
服部和柯南通话，柯南得知瑛祐的父亲极为沉默寡言，其工作伙伴总是穿黑衣，每次同行者对他的称呼也都不同。
File.584
柯南和灰原进行调查，得到一张意外拍到瑛祐父亲的照片，并得知他父亲受雇于“Company”。
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
File.585
柯南和服部通话讨论搜查结果，两人都认为若瑛祐父亲确实是“Company”（即CIA）的人，会使事情变得更加棘手。
瑛祐四处寻找与水无伶奈长得完全相同的姐姐。
File.586
柯南借由水无的新闻录影及瑛祐的话推得水无和瑛祐姐姐的血型不同，因此两者为不同人，并进而推出瑛祐寻找水无的真正理由。
File.587
柯南请茱蒂调查瑛祐父亲的身份。
柯南从瑛祐母亲遗物中的母子手册确认水无和瑛祐的姐姐必为不同人。
494 红与黑的碰撞 冥土
File.590
案件解决后，柯南看见瑛祐打赤膊后感到有些怪异。
无
File.595
瑛祐在杯户中央医院里听到与父亲传给同事邮件信箱发出相同的按键音（为童谣《七个孩子》的旋律）后失踪。
495 红与黑的碰撞 昏睡
File.595
小兰提到瑛祐失踪联系一阵子，似乎是因为他在杯户中央医院里发现线索。
茱蒂查出瑛祐父亲的本名叫伊森·本堂，在4年前被水无杀害。
柯南借由瑛祐发现的线索得知医院内有黑衣组织的同伙。
File.596
赤井在谈话中提到“NOC”，令柯南有些在意。
496 红与黑的碰撞 侵入
File.596
柯南从护士得知瑛祐曾做过白血病手术。
水无虽已恢复意识，仍假装在昏迷状态。
File.597
柯南和FBI试探3个疑似组织同伙的病患。
柯南假藉有东西忘在病房的名义观察水无。（柯南由床垫的皱褶变化得知水无已经恢复意识）
File.598
柯南和FBI由刺探的结果得知假扮成病患的组织同伙为楠田陆道。
497 红与黑的碰撞 觉醒
File.598
楠田为躲避赤井的追捕便朝自己头部举抢自尽。
File.599
柯南得知赤井与宫野明美是恋人关系，曾化名诸星大卧底于黑衣组织，组织内的代号为Rye，在2年前的一次行动中因某位搜查官（即卡迈尔）的失误被组织抛弃。
赤井重新回顾宫野明美传来的简讯，并回忆两人相识的经过。
File.604
柯南问赤井：“这场孤注一掷的大赌局（指赤井要佯装死亡，改换身份潜伏调查），你有没有兴趣参与啊？”，赤井答应这项要求。
柯南用“蝴蝶结变声器”让赤井暂时离开（赤井因此得知柯南“变声”的秘密），使瑛祐有机会潜入病房。
File.599
瑛祐潜入病房内质问水无关于姐姐本堂瑛海的情况，准备刺杀时，却被水无阻止。
此时，刚来到医院的卡迈尔正在与其他人（即赤井）通话。
500 红与黑的碰撞 遗言
File.604
瑛祐以水无的反应得知水无就是他姐姐瑛海，柯南解释瑛祐小时候曾为了治疗白血病而以姐姐的骨髓进行移殖手术（由于HLA的缘故），他的血型是在经过化疗放射线破坏后改变的。
柯南表示自己是借由测谎动作及Vermouth的暗示得知水无的CIA情报员身份。
水无提到他原本的任务是引荐继任的联络员给卧底的父亲。
水无也表示委托小五郎协助调查“门铃怪客”主要是为了取得联络方式，请他保护瑛祐。
赤井提议水无再度回到组织里卧底。
无
File.897
赤井为避免留下指纹，事先用胶水使手指形成涂层。
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
File.600
FBI讨论将水无送出院的作战计划时，赤井左手拿的咖啡罐意外掉落。
隔天早上，黑衣组织制造3起事故使大批病患涌入医院。
File.601
组织以楠田陆道的名义将大量炸弹包装成慰问品送给病患。
FBI回收炸弹时发现医院的电视里播放出水无伶奈的影像。
File.602
赤井和柯南发现这些行动是组织透过一连串诱导，使FBI无意间暴露水无病房的所在位置。
由于组织已经得知水无的行踪，詹姆斯下令立刻将水无带出医院。
柯南建议可以用阿笠博士的金龟车载水无，赤井否定这项意见，并用右手将柯南的手机关起来。
赤井则另外提出一个妙计，卡迈尔自愿担任载水无的司机。
赤井对表情不安的柯南说：“不要露出那种表情嘛。”
茱蒂因卡迈尔的言论感到不放心，却被卡迈尔击晕。
File.603
运送水无的过程中，组织成员跟车在后，Gin利用热像仪及发信器正确地判断出载有水无的箱型车。
水无利用炸弹盒将卡迈尔击昏，迫使箱型车停下来，并重新回归黑衣组织的行列。
File.604
赤井向FBI透露“将水无‘送’回组织”是他和柯南一起拟定的战略。
茱蒂和詹姆斯抱怨为何不先告知计划内容，赤井回答：“我要的不是演戏，而是真实情感。”
501 红与黑的碰撞 嫌疑
File.605
赤井表示让水无重新回到组织并非是当FBI的线民，而是以CIA情报员的身份调查。
Gin不相信赤井会订出让组织轻易夺回Kir的计划，怀疑这背后还有内情。
柯南向灰原提到FBI正在说服瑛祐答应“证人保护计划”。
灰原相当好奇赤井这号人物，但柯南不愿透露信息。
502 红与黑的碰撞 洁白
File.606
卡迈尔提到他2年前曾来过日本。
茱蒂欲解救涉嫌杀人事件的卡迈尔时，赤井说他今天有种不好的预感。
成功将水无“送”回组织之后，水无接到来自Boss的任务：“杀死赤井秀一”。
File.607
卡迈尔回忆因个人疏失导致赤井身份曝光的经过。
赤井接到水无的来电并答应两人单独会面。
詹姆斯欲打电话叫茱蒂回来讨论对策，却被赤井用左手阻止下来。
783 绯色的真相
File.898
詹姆斯发现赤井手掌的异常，赤井于是向其透露完整的计划内容。
503 红与黑的碰撞 决死
File.607
柯南发现茱蒂的手机有问题，便主动将自己的手机借给茱蒂。
File.608
赤井赴会前对詹姆斯说：“接下来的事就拜托你了…”
504 红与黑的碰撞 殉职
File.608
赤井将车停在来叶山道的山谷边，从副驾驶座下车，右胸中枪时，右手却一直插在口袋里。
File.609
水无将手枪对准赤井的头部，赤井感慨地说：“没想到竟会走到这一步…”，水无回应：“我也很惊讶，居然进行得那么顺利…”
水无在成功枪杀赤井后引爆炸弹。
FBI透过新闻得知来叶山道发生一起火烧车事故，车内有一具焦尸。
茱蒂想起赤井曾碰过柯南的手机，可以拿来确认指纹。
鉴识的结果证实焦尸的指纹与赤井的相符合。
事后，茱蒂将手机还给柯南，而柯南发现手机序列号不同，因此得知手机已被掉包。
柯南未追问手机被掉包的原因，随后沉默一阵子。
507-508 卡拉OK包厢的死角
File.621
瑛祐拒绝“证人保护计划”，打算前往美国，并借由套话得知柯南的真实身份。
瑛祐说FBI里似乎有人殉职，柯南微笑地表示“不要紧”。
509 红白黄色与侦探团
File.622
水无急报：“组织派出厉害的成员波本（Bourbon），并拥有过人的情报收集能力、观察力和洞察力。”
自称东都大学工科研究生的冲矢昴（赤井秀一易容）以纵火嫌疑人登场，此时，灰原感受到组织的气息，但一下子就消失。
File.623
冲矢声称他最喜爱及最厌恶的颜色为黑色，并根据柯南的推理提到《铜山毛榉案》，表示自己相当着迷福尔摩斯。
510 柯南vsW暗号推理
File.624
由于冲矢所居住的公寓遭人纵火烧毁，于是询问是否可以暂时寄居博士家，但遭到灰原拒绝。
柯南建议冲矢可以去借住新一家，高兴地把家门钥匙交给他，并希望他能“好好看家”，
而灰原欲劝告阻止时却被柯南以“福尔摩斯迷一定不是坏人”为理由打发。（暗示柯南对冲矢极为信任）
File.638
小兰和园子准备在工藤宅打扫时，正巧碰见冲矢在用左手刷牙。
小兰认为是小偷入侵并用空手道攻击时，却被冲矢巧妙地假装被击倒，还觉得冲矢有似曾相识的感觉。
510-511 推理对决！新一vs冲矢昴
File.639
小兰和园子发现冲矢的推理能力很强。
由于柯南说要保密与新一有关的事情，小兰便编造屋主是“金一”以回应冲矢的疑惑。
File.640
案件解决后，冲矢坐在书桌前笑着喝波本酒。
521 杀人犯 工藤新一
File.646-647
柯南误服灰原制作的解药试验品，第三次恢复工藤新一之身。
522 新一的真实身份和小兰的眼泪
File.652
药效即将消失时，灰原和博士及时给新一送来另一颗解药。
灰原提到若是频繁服用解药，将会产生抗药性，维持药效的时间会缩短。
542-543 鱼儿消失的一角岩
File.665
冲矢展现出色的推理能力，灰原觉得他很可疑。
File.666
犯人突然挟持步美，冲矢以出乎意料的言论挑衅，此时，灰原再次感到压迫感。
冲矢成功打掉犯人的匕首，迅速地从犯人怀中救下步美。
灰原借此事件几乎笃定冲矢一定是黑衣组织的成员。
无
File.824
Bourbon为了确认赤井秀一的生死，便假扮成赤井模样的伤疤男，以观察周遭人的反应。
563-564 侦探团vs强盗团
File.677
卡迈尔提到赤井很喜欢喝波本酒。
茱蒂遇见疑似赤井的伤疤男。
File.679
“伤疤赤井”用右手开枪救下被绑匪抓住的柯南。
578 引发危机的红色前兆
File.699
少年侦探团提到在银行抢案时，有见到“巴士劫持事件”中戴着黑色针织帽的男子，但他的脸上多一道伤疤，柯南得知后大惊失色。
579 黑色13的暗示
File.700
Vodka提到新闻中出现与长得赤井相似的男人。
“伤疤赤井”再次出现，此时，在商场的茱蒂收到“这里很危险，快逃！”的字条。
File.701
Gin欲检验赤井秀一是否生还，并以此来证实Kir是否是卧底，于是派Chianti、Korn在商场附近埋伏。
580 步步逼近的黑色期限
File.702
Gin质疑Kir枪杀赤井时有事先动过手脚。
此时冲矢也在商场，首次见到“伤疤赤井”，并未被其发现。
File.703
Kir提到Bourbon是为了搜索Sherry而出动，Gin则表示Bourbon也是“秘密主义者”，Vodka也说Bourbon亦十分痛恨赤井。
“伤疤赤井”用别人的手机将自己对商场案件的推理发给小五郎。
581 摇曳的红色目标
File.703
冲矢在窗边看见Gin的保时捷和拿着来福枪准备狙击的Chianti。
File.704
茱蒂得知组织的行踪后欲阻止“伤疤赤井”出商场大门时，被冲矢撞倒在地上。
冲矢对茱蒂说：“我们双方的过错各占一半。”
Vermouth前来阻止Gin的暗杀行动，并提到boss是属于“因敲击过度而使石桥垮下来（比喻行事谨慎固执）”的人。
“伤疤赤井”突然对着瞄准镜露出诡异的笑容。
事后，柯南从冲矢的话可得知他也在寻找“伤疤赤井”，但冲矢表示似乎是认错人，并说：“毕竟是从以前就非常熟悉的面孔，不可能会看错。”
616-621 福尔摩斯默示录
File.743
柯南因缘际会可以前往伦敦，并因“江户川柯南”没有正式户籍而不能出国的原因第四次恢复身体。
File.752
新一首次向小兰正面表白。
工藤夫妇得知灰原是APTX-4869的研发者。
File.749
柯南在温布顿网球赛的直播自称是“福尔摩斯的弟子”。
1045-1046 遭天谴的生日宴
File.1048-1049
玛丽在伦敦沃克斯霍尔桥遇到赤井务武，然而发现对方为Vermouth假扮后被后者喂下其妹妹（即宫野艾莲娜）制造的APTX-4869，坠入泰晤士河后变小。
File.1025
File.1050
世良和玛丽从温布顿网球赛的直播得知柯南出现在伦敦，从而回想起10年前自称是“福尔摩斯的弟子”的新一，确认两者为同一个人并拥有恢复身体原状的解药，玛丽要求世良接近柯南，从而取得解药，因此从伦敦回到日本。
646-647 幽灵旅馆的推理对决
File.768
自称侦探的假小子世良真纯首次登场，并展现出优异的截拳道身手。
File.769
推理案件的过程中，世良相当关注柯南的意见。
File.770
世良推理错误，于是柯南用新一的声音打电话来解决案件。
案件解决后，世良正式转入帝丹高中。
648-650 侦探事务所挟持事件
File.771
世良提到她3年前开始住在美国，最近才回到日本。
柯南认为世良是故意推理错误，并觉得似曾相识，而且不像是坏人。
File.774
世良表示她借此事件得知柯南和工藤新一的交情非常好，还认为小兰比自己想像中还要难应付。
651 柯南vs平次 东西侦探推理对决
File.778
卡迈尔意外碰上命案，世良得知是FBI后有特别反应。
File.780
茱蒂和卡迈尔感觉世良很像某个人，詹姆斯则一眼看出世良是女孩子。
656-657 博士的视频网站
File.775
世良向光彦、元太打听“博士家的小女孩”（即灰原哀）及新一的情报，并看着新一家的窗户说：“我还以为是谁擅自住进来了呢，不过现在看来真是杞人忧天了啊…”，此时冲矢正躲在窗边看着。
冲矢跟踪准备采购咖喱食材的少年侦探团。
File.776
冲矢用窃听器听柯南和灰原的对话。
File.777
柯南不解世良为何能在看博士上传的影片后，一眼就发现从博士眼镜片中印出灰原的影像。
事后，世良将意外拍到灰原影像的影片从电脑中删除。
667-668 婚礼前夕
File.793
自称侦探的安室透首次登场。
File.795
安室因崇拜“沉睡小五郎”的推理，自愿成为小五郎的弟子
671-674 侦探们的夜想曲
File.796
柯南帮毛利侦探事务所架设好网站。
File.798
安室透借由套话得知小五郎的电脑密码。
File.800
冲矢脱口而出的一句“不要露出那种表情嘛”，让灰原感到相当在意。
Vermouth打电话并在远处看着世良、冲矢、安室三个人说：“你会遵守我们的约定（指不论在何种情况下，都要确保柯南与小兰不会受到组织加害）吧？Bourbon。”
世良、冲矢、安室三人此时也各自接起电话。
675-676 一丁点都不原谅
File.801
世良似乎对新一早就有了解的样子，并对灰原也表现出兴趣。
世良表示自己认识一个“从来不笑的人”（即赤井秀一），注意到“伤疤赤井”的存在后对其相当关注。
File.802
灰原回想起冲矢的那句“不要露出那种表情嘛”，和曾在组织卧底的诸星大（即赤井秀一）的用语十分相似。
681-683 赌上性命的恋爱转播
File.808
安室透偷偷来到高木涉的指导警官伊达航的坟墓，从安室手机中留着的讯息和放在墓碑前的牙签来看似乎与伊达航交情不错。（警校时期就认识的朋友）
684-685 泡沫 水蒸气与香烟
File.810
冲矢与灰原的对话表明他曾与某人做过约定。
File.811
灰原欲确认冲矢的颈部是否有隐藏秘密，却被阻止说：“这里是我的地盘，并不属于你的领域。”
690-691 工藤优作的未解决事件
File.812
园子提到冲矢总是穿戴高领服装，颈部似乎有秘密。
冲矢举止可疑，虽然证实颈部无异样，但却没有说话，并在众人离开后左手拿出之前藏起的梳子。
世良在房间中发现女性线索及假发，冲矢因此被怀疑真实身份。（“女性线索”为工藤有希子所留）
File.813
冲矢从小兰与世良对话的矛盾中得知屋主为工藤新一而非“金一”，并看到柯南用新一的声音打电话后得知其真实身份。
File.814
事后，世良含泪回望柯南和小兰说：“我果然是个坏孩子呢…”
699-700 逼近灰原秘密的黑影
File.815
世良问小兰阿笠博士的车子颜色，假装在群马县与柯南偶遇，并试图让柯南通过她的手机与灰原联络。
File.816
而灰原和步美等人困在被凶手纵火的小木屋中，灰原为了帮助大家逃生而服下APTX-4869解药暂时恢复真身。
File.817
世良对光彦拍下的影片中的宫野志保表现的非常惊讶。
安室私下进入毛利侦探事务所，潜入小五郎的电脑并得到影片。
此时，冲矢通过骇入小五郎的电脑也看到此段影片。
701-704 漆黑的神秘列车
File.818
黑衣组织得知宫野志保将乘坐神秘列车。
Vermouth假扮成“伤疤赤井”潜入列车，确认Sherry已上车。
File.820
灰原在车厢走道上遇见“伤疤赤井”后感到一阵恐惧，此时冲矢在一旁的包厢内与一名神秘女性（即工藤有希子）说出一段意味深长的话。
Gin和Vodka已在终点站埋伏。
File.821
灰原收到Vermouth发来的邮件后离开包厢，并掏出药盒开始回想起母亲宫野艾莲娜在录音带中提到的事。
冲矢对灰原说：“真不愧是姊妹，行动太容易摸透了，到我的领地来吧！”，灰原听到后立刻转身逃跑。（灰原后来被柯南和有希子安置在命案房间内）
世良遇见了“伤疤赤井”，喊了他“秀哥！”
File.822
世良认为赤井已去世，因此质问“伤疤赤井”，被其以电击棒击昏。（世良后来被冲矢带回包厢安置）
“伤疤赤井”传简讯给别人表示：“障碍已清除，按计划继续进行。”
File.823
Vermouth扔掉有希子的变装工具。
有希子表示Vermouth可能是基于某些理由才会向隐瞒组织因药物导致幼儿化的情报，另外还提到Vermouth曾委托板仓卓制作软件一事。
Vermouth引发排烟装置，安室却称车上正发生火灾，让所有乘客往车头避难。
File.824
柯南趁乱揭穿怪盗基德的伪装，并委托他假扮成宫野志保。
File.823
“宫野志保”来到列车尾部，安室对其揭晓自己是组织的一员——Bourbon。
File.824
Bourbon称假扮“伤疤赤井”是为了调查赤井的生死，通过周遭人的反应也确定赤井是真的死亡。
Bourbon将“宫野志保”逼入最后一节车厢，身后突然出现疑似赤井样貌的身影并往车厢连结处扔出手榴弹。
与此同时，Vermouth也引爆事先放置在最后一节车厢的炸弹来杀死“宫野志保”，假扮志保的怪盗基德机警地乘滑翔翼逃离。
列车停靠后Vermouth发现Sherry未死，但未告诉其他组织成员。
安室对赤井之死再度产生怀疑，准备重新调查，此时，冲矢露出与赤井秀一相同的眼神。
706 推理的波本
File.827
安室发现柯南使用麻醉针的动作。
Vermouth劝安室离开毛利小五郎，安室拒绝并称对“沉睡小五郎”产生兴趣。
722-723 香甜冰冷的宅急便
File.843
安室救少年侦探团于险境，冲矢昴通过楼上的窗户目送他离开。
724-725 怪盗基德与赤面人鱼
File.828
世良重提“神秘列车”上帽子丢失的事情，询问小兰有没有见到“伤疤赤井”，并向众人提到自己有位已经死去的哥哥（即赤井秀一）。
727-728 装满水果的宝箱
File.845
柯南对世良微笑时露出的虎牙有特殊反应。
File.846
小兰在看着世良跑远的背影不由自主地说出“波浪…”，并说：“看着世良跑走的背影，耳边总会响起海浪涟漪的声音。”
柯南悄悄问世良：“你和我在哪里见过吗？”，但世良未正面回答，并想：“很抱歉，现在还不能告诉你，因为还没到时候…”
731-732 现场的邻居是前男友
File.847
女警宫本由美的前男友将棋名人羽田秀吉首次登场，声称自己拥有世界第一的瞬间记忆力。
File.848
秀吉展现出的记忆推理能力，并发觉柯南拥有优于常人的思维。
734 茱蒂的追忆与赏花的陷阱
File.850
柯南告诉茱蒂伤疤赤井为Bourbon假扮，拜托她调查安室未离开波洛咖啡厅的原因。
灰原认为赤井与她在组织里认识的某个男子（诸星大，即赤井化名）极为相似，但柯南立即否认。
File.851
茱蒂回忆起在杯户中央医院调查组织间谍的事情，却遭到柯南连忙阻止。
File.852
Bourbon成功窃听柯南和朱蒂的对话，并称柯南为“可怕的男人”。
738-739 小五郎在酒吧
File.855
柯南通过与高木警官的对话发现“神社事件”中的赏樱游客弁崎桐平及其“妻子”为Bourbon和Vermouth所假扮。
740-741 小兰也倒在浴室里
File.856
Bourbon暗中观察柯南在得知“神社事件”的矛盾后的反应。
File.857
柯南发现世良私下与别人通电话。
744-745 嫌疑犯是京极真
File.859
世良表示之前通话的对象为自己的二哥（即羽田秀吉），并提到二哥与自己及大哥长得不像。
柯南怀疑世良早已知晓其真实身份。
File.860
由世良与二哥的简讯内容得知二哥曾见过柯南，并相当认可柯南的能力。
File.861
事后，二哥询问世良是否已见到“魔法师”（即工藤新一）。
754-756 赤女的惨剧
File.872
世良提到她们家三兄妹的姓氏皆不同，父亲（即赤井务武）早已去世，而“世良”则是母亲的旧姓。
File.874
由世良的内心活动可得知其回国的主要缘由为再次与“魔法师”相遇。
File.875
世良要柯南帮她找手机，柯南在世良的手机萤幕上看见世良与金发少女的合照，随即推断世良是故意要让他看到照片。
759-760 恋爱小说的意外结果
File.876
世良表示其父亲的好友为有钱人家，一直资助自己居住酒店。
File.877
柯南在围观人群中看到世良手机照片上“长得很像世良、初中生年纪”的女孩的身影，但女孩很快跑走，而世良则在一旁观察柯南的举动。
File.878
长相和世良相似并自称为“领域外的妹妹”的少女（即玛丽·世良）首次登场。
770-771 气氛僵硬的茶会
File.888
安室到医院调查楠田陆道之死，并提到自己幼年的外号“零”。
File.889
安室看见柯南与兰的互动后回想起幼年的往事，而回忆中出现一名长发女性（即宫野艾莲娜）。
File.890
安室获取楠田陆道的车上有手枪血迹的情报。
779 绯色的序章
780 绯色的追寻
File.891
柯南请茱蒂转告FBI不要将楠田陆道是举枪自尽的事情泄漏出去。
File.892
安室得知茱蒂和卡迈尔是FBI搜查官后，便开始有意无意地出言挑衅。
柯南询问安室：“你是敌人吧？那些坏蛋的…”，安室回答：“看来你似乎对我有些误解…”
File.893
柯南原先认为安室可能是日本公安的卧底，但根据其回应感到相当恐惧。
Bourbon与Vermouth设局让卡迈尔透露出楠田陆道自杀的消息。
781 绯色的交叉
782 绯色的回归
File.894
Bourbon由楠田陆道自杀的情报推理出赤井秀一诈死的真相。
File.895
Bourbon至工藤宅向冲矢昴（工藤优作假扮）说明赤井诈死的经过。
此时，茱蒂和卡迈尔为了调查赤井死亡的真相而驱车前往来叶山。
茱蒂从赤井的口头禅：“各占一半。”得知冲矢就是赤井。
File.896
Bourbon试图揭穿冲矢的假身份的同时，赤井以真面目出现在茱蒂、卡迈尔的车上。
783 绯色的真相
File.897
赤井揭穿Bourbon的真正身份乃日本公安警察——降谷零，并劝告“不要搞错了真正敌人，不应为一时之利而忘记了目标。”
赤井也向Bourbon表示至今仍对“他”的事情（指Scotch自杀一事）深感抱歉。
File.898
赤井提到詹姆斯早已知晓诈死的计划。
由Bourbon和Vermouth对话得知，Vermouth与Boss有着非比寻常的关系。
Vermouth表示Gin现在非常重视“组织老鼠”的问题，并提到已故的公安卧底（即Scotch）。
事件结束后，水无紧急传送一则简讯给赤井，简讯内容仅有“RUM”三个英文字母，赤井表示是一个组织地位比Gin高的人物。
785-786 太阁恋爱的名人战
File.902
与世良同住饭店的“领域外的妹妹”，在世良外出时认真关注秀吉的将棋名人战，而冲矢（赤井）透过网络新闻得知秀吉获胜后亦露出微笑。
787-788 沉入盛夏游泳池的谜团
File.903
小兰因“魔法师”一词想起过去可能跟世良见过面，正要确认时被园子打断。
File.905
小兰与世良道别后瞥见“领域外的妹妹”，并对其有印象。
792-793 三人是第一发现者
File.906
灰原提到组织第二号成员朗姆（Rum）的特征：“组织成员对他的印象众说纷纭，有人说他是个老人，有人说他是个女性化的男人，也有人说他的体格相当健壮。”
File.908
案件解决后，灰原想起：“Rum曾意外伤到眼睛，现在有其中一只眼睛为义眼。”
808-809 镰鼬旅馆
File.910
柯南意外发现大和敢助警官相当符合灰原对Rum所描述的特征。
810-812 县警的黑暗
File.913
长野县警搜查一课课长的独眼壮汉黑田兵卫首次登场。
File.914
上原由衣警官提到黑田曾遭逢意外，昏迷将近10年，也似乎因为承受太多压力使外表突然变得和以往判若两人。
File.916
柯南发觉黑田对自己的事情有一定程度的了解。
814-815 部落格女演员的密室事件
File.920
黑田由长野县调回警视厅接任搜查一课管理官的职务。
File.918
柯南对黑田的言行及对自己的态度有些在意。
File.920
案件解决后，黑田当众肯定柯南的能力，而灰原却对其产生恐惧反应。
822-823 嫌疑人是热恋情侣
File.925
灰原表示之前对黑田感到恐惧，纯粹是因为其面貌所致。
827-828 好吃到要命的拉面2
File.928
世良对自己二哥的评价和由美对前男友秀吉的性格描述极为雷同。
File.929
由美打电话给秀吉，世良也同时打电话给二哥，而此时秀吉却先后挂断电话，柯南亦发觉由美和世良的动作异常同步。
File.930
事后，柯南从拉面店老板手中拿到世良遗留在店里并写有“Mary”字样的手帕，柯南对于Mary这个名字有印象。
836-837 关系不好的女子乐队
File.936
世良觉得安室很面熟，但遭到否认。
File.937
柯南透过世良对自己大哥的描述，确认赤井与世良为兄妹，且一名被称为“Scotch”的人与赤井要好。
File.938
案件解决后，世良表示自己会当侦探是深受当FBI的大哥（即赤井）影响。
安室虽未表态，但显示Scotch也是日本公安，且与安室熟识，安室更认定其为赤井所杀。
843-844 不明真相的侦探团
File.939
柯南确认世良与赤井为兄妹后，怀疑世良来日本的原因与“领域外的妹妹”有关。
File.941
案件解决后，柯南意外发现灰原有着与“领域外的妹妹”相似的眼神。
847-848 千叶的UFO疑难事件
File.942
柯南因小五郎一句“相似”，开始思考宫野家族与赤井家族是否有血缘关系，在想到赤井秀一与宫野明美曾为情侣一事而感困惑时被小兰打断。
849-850 结婚申请书的密码
File.947
灰原从由美与男友秀吉通话中得知羽田浩司（一位曾最接近7冠王头衔却意外身亡的日本棋士）为秀吉的义兄，并告诉柯南她曾在遭组织强灌APTX-4869的人物名单上看过这名字。
861-862 与17年前同样的现场
File.948
柯南调查羽田浩司事件，得知后者在17年前遭人袭击身亡，一名事发后消失踪影，称为“浅香（Asaca）”的保镖涉有重嫌，且可能是黑衣组织的一员。
灰原提到APTX-4869原先可能是其父母所研发，后来灰原是参考残留的资料才重现此药物，而灰原的内心则表明组织真正要她制作的却是别种药。
File.949
柯南与冲矢（赤井）因阿笠博士发明的剪刀卷入一起杀人案，并借此案件得知迫使赤井加入FBI的动机与羽田浩司及赤井的父亲有关。
File.950
柯南和冲矢发现被害人留下死亡讯息的手法，以此得知羽田浩司遗留的死亡讯息“ASACA RUM”，并进而认为此事件可能与“浅香”及黑衣组织的Rum有关联。
863-864 灵魂侦探杀害事件
File.951
柯南由17年前羽田浩司所留下的死亡讯息推测Rum与“浅香”为同一人，开始思考羽田浩司所服下的毒药与APTX-4869之间的关联。
柯南和小五郎发现世良就住在欲揭开羽田浩司真相的灵魂侦探遇害现场的隔壁房间。
File.952
世良与“领域外的妹妹”听到“羽田浩司事件”的相关信息后，两人的反应皆异常激动。
File.953
“领域外的妹妹”意外捡到柯南的“蝴蝶结变声器”，并透过世良的协助用小五郎的声音说明杀人案的真相。
“领域外的妹妹”运用过人的身手制伏犯人，柯南发觉急忙赶到现场的世良向其喊声“妈妈”。
由“领域外的妹妹”的话可得知她在10年前就已经见过柯南（新一）。
柯南得知世良与“领域外的妹妹”的关系后就认定后者就是浅香。
而这起杀人案也传到黑衣组织内，Gin表示“羽田浩司事件”是Rum在17年前搞砸的烂摊子，而Gin亦对“沉睡小五郎”的再度介入起疑心。
另外，“领域外的妹妹”与Gin都提到“不明真相，恐有暗鬼！”
866-867 背叛的舞台
File.954
一名歌手将发表17年前已作曲并命名为“ASACA”的新歌曲，柯南、冲矢（赤井）、安室（Bourbon）及榎本梓（Vermouth假扮）透过小兰与园子参与演唱会彩排的机会前去试探，但众人却在彩排会场发现该歌手已吊死在舞台上。
File.955
小梓不自觉地称呼小兰为“Angel”，而小兰则对此称呼有似曾相识的感觉。
柯南看穿Vermouth的伪装，却担心波及小兰与园子而不采取行动。
Vermouth与Bourbon提到两人承诺的约定，但Bourbon仍不知此举的缘由为何。
安室发现冲矢是左撇子而再度起疑心。
File.956
小兰想起“Angel”的称呼与之前企图绑架柯南及灰原的女人相同。
赤井与Bourbon也在调查过程中想起Scotch的事情。
File.957
杀人案在柯南、冲矢与安室联手下破案，众人也得知新歌曲“ASACA”与黑衣组织无关。小兰想与小梓确认身份，而后者只跟小兰说别再深入。
878-879 试衣间的死角
File.969
柯南见到世良的泳装后，脑海中出现4个神秘人物（玛丽‧世良、赤井秀一、羽田秀吉、世良真纯）的身影，并想起小兰当时也有在场。
File.971
柯南从世良言行的矛盾得出世良是去英国留学而非美国，并进而想起10年前两人相遇的经过。
881-882 涟漪中的魔法师
File.974
柯南认为世良确实已经知晓自己的真实身份为工藤新一。
柯南也发觉世良的二哥是羽田秀吉，被秀吉称作“玛丽妈妈”的女人就是“领域外的妹妹”，并猜测“领域外的妹妹”亦曾遭人灌下APTX-4869。
世良发现柯南已经想起10年前的事情，并认为柯南尚未明白被称为“魔法师”的真正理由。
889-890 新任教师的骸骨事件
File.966
浅香化名为若狭留美登场，成为帝丹小学1年B班新任的副班主任。
894-895 隔壁的江户前推理秀
File.975
伊吕波寿司店厨师胁田兼则首次登场。
胁田自称左眼“长了很不得了的东西”，并用眼罩将其遮盖，令柯南想起灰原曾经提到组织第二号成员Rum的特征。
File.977
胁田因崇拜“沉睡小五郎”的推理，自愿成为小五郎的弟子。
896-897 手臂白皙的女人
File.980
若狭运用过人的身手制伏犯人的事情登上新闻，令黑田及胁田得知。
909-910 燃烧帐篷的怪物
File.987
黑田在网上浏览羽田浩司事件，并怀疑之前登上新闻若狭留美。
黑田借由白鸟警官的对话得知若狭将会带着少年侦探团去露营后，决定跟随前往。
柯南怀疑若狭故意让自己遇上之前的事件。
若狭听到“义眼”一词时产生异常反应。
File.988
柯南及灰原得知她右眼看不见。
若狭暗中让柯南想到了作案手法。
File.989
灰原不允许柯南说若狭的坏话。
柯南发现若狭口袋内有东西。（角行将棋）
927-928 红色的修学旅行
File.1000
柯南参加帝丹高中京都修学旅行，第五次恢复身体。
File.1004-1005
小兰亲吻新一的脸颊，回应新一在伦敦的表白，并正式发出交往的请求，两人正式成为情侣。
File.1005
世良确认有能让其妈妈玛丽（领域外的妹妹）恢复身体原状的解药，玛丽要世良找出解药的开发者，把解药抢过来，以结束躲藏的日子。
941-942 寻找玛莉亚！
黑田、胁田、若狭得知新一在京都解决案件。
若狭留美拥有APTX-4869的人物名单。
File.1006
若狭向灰原询问有关新一的事情。
File.1008
胁田在博士家询问有关新一家的事情。
工藤夫妇平息新一在京都的轰动。
Bourbon接获Rum信息，要求其提供工藤新一的情报。
赤井与优作共同推理出羽田浩司一案所遗留暗号的真正信息“CARASUMA”，指向半世纪前离奇死亡的日本富豪“乌丸莲耶”。
952-954 充满谜团的鸡尾酒
File.1011
安室回想起与宫野夫妇的过去。
File.1012
安室（Bourbon）潜入新一家，发现赤井与工藤夫妇早已在此（未交代后续）。
971-974 目标是警视厅交通部
File.1015
黑田要求安室向柯南提供案件的资料。
File.1016
秀吉简讯大哥赤井，要求他保护由美的安全。
File.1017
黑田称呼安室为Bourbon。
983-984 基德vs高明 被瞄准之唇
File.1020
上原由衣提到诸伏高明有一个弟弟，在其双亲去世后被东京的亲戚领养，据说进了警视厅。
高明表示其弟弟后来找到新的工作而离开，已经很久没有消息，不知道在什么地方做着什么事情。
File.1021
高明在伊达航置物柜的信封中收到弟弟诸伏景光（即Scotch）自杀时打穿的手机，便推测其成为公安潜入某组织后殉职。目前不知道寄信人的身份，但在信封上有个“0”的字样，而联想到景光曾告知他有一位在东京的朋友外号为“零”（即安室透）。
993-995 替身·京极真
File.1023
世良为了让柯南说出解药的开发者，询问小兰新一出现的时候，柯南是不是就不在啊？
File.1024
小兰刚好回想起帝丹高中学园祭的时候新一和柯南有同时出现过，否定了世良的猜想。让世良感到非常吃惊。
File.1025
世良突然称呼柯南为“工藤新一”，柯南急忙否认。
世良回忆起玛丽去伦敦找务武，结果却变成少女的样子回来。
世良成功从小兰和园子的口中得知了灰原的存在，回想起就是曾经在“神秘列车”事件中见过的那个小女孩。
1003-1005 36方格的完美犯罪
File.1027
胁田说希望自己可以拥有看出背叛者的能力。
File.1029
柯南向安室询问Rum的情况，安室表示Rum是一个非常性急的人。
高明在视频中看见安室，觉得其很面熟。
File.1030
胁田怀疑柯南和安室的密切关系，并表示很期待柯南长大的样子。
高明回忆起安室是其弟弟景光介绍过的朋友，怀疑把景光的手机还给自己的人就是安室。
高明与黑田进行私人通话（未交代通话内容）。
File.1031
高明在与安室、胁田见面后向安室暗示“一刻千金……一寸光阴一寸金”，并心想“俗话说……时间就是金钱”。
1011-1012 采野菜和四叶草
File.1032
若狭闻到血腥味时联想到羽田浩司的死状。
File.1033
若狭由步美口中的“护身符”一词联想起羽田浩司手持角行将棋说出将棋格言（日语：将棋の格言）“远角有好招”（遠見の角に好手あり）和羽田浩司死亡后的情景。
File.1034
若狭发现柯南对群马县警山村操使用麻醉针，案件结束后扔掉了步美送给她的四叶草。
1018-1020 无法隐藏的古董盘
File.1035
灰原怀疑自己被世良窥探，冲矢（赤井）恰好来到博士家，世良紧随其后。
File.1036
世良称灰原“果然很成熟”，并质问冲矢怎么知道她是个女孩。
File.1037
世良怀疑冲矢以前就认识她，冲矢（赤井）在与柯南说悄悄话时回想起17年前从英国赴日途中家人的对话。
世良向灰原询问APTX-4869解药的事情，被冲矢察觉到异样，便询问其身边的某个人需要解药的事情。世良对冲矢使出飞踢，却被轻松闪避。冲矢对世良说：“我们双方的过错各占一半。”后问到其母亲是否在世。
柯南推理出“领域外的妹妹”可能与英国军情六处（SIS）有关。
File.1038
冲矢（赤井）怀疑世良另有隐情，但已大致猜出。
柯南怀疑玛丽的真实身份是军情六处情报员，世良也在玛丽面前提到了冲矢“各占一半。”的口头禅，得知为父亲及大哥的口头禅后，并怀疑冲矢的真实身份为自己的大哥赤井。
1024-1025 大冈红叶的挑战书
File.1042
柯南从大冈红叶的管家伊织无我得知四兄弟的母亲在羽田家做女佣后，由此推理出羽田浩司是有钱人家的公子。
1033-1035 太阁名人的将棋盘
File.1043
由美称作为有钱人家的羽田家为了完成羽田浩司未完成的梦想而收养沉迷于将棋的秀吉，并以为秀吉的家人和秀吉一样“乐呵呵慢吞吞”。
File.1045
秀吉在劝犯人自首时被绑架，柯南致电赤井求助。
赤井没有变装便离开工藤家，在优作的建议下带上柯南一起去营救秀吉。
File.1046
柯南和赤井联手救出秀吉，但秀吉并不知道母亲变小的事情。
1045-1046 遭天谴的生日宴
File.1047
世良发现柯南的药盒持有一颗APTX-4869解药，玛丽要求世良想办法抢到解药。
File.1048
玛丽听到“毒杀事件”后回想起数月前在沃克斯霍尔桥的遭遇。
File.1050
世良抢到了柯南的药盒，但解药仍在柯南手中。
1053-1054 坠入牧场的火种
File.1051
若狭在牧场不小心将自己携带的角行将棋丢失，被安室捡到后发现上面有划痕，并且似曾相识。
File.1052
安室回忆起自己在公安研修课上了解的羽田浩司案，发现自己捡到的将棋与羽田浩司的护身符极为相似，并怀疑杀死羽田浩司的犯人在牧场里。
File.1054
若狭打晕安室后夺回将棋。
1059-1060 冲野洋子与阁楼的密室
File.1057
胁田对柯南提到“本该有的东西不见了，比如将棋的棋子之类的”。
安室对若狭有所关注。
1071-1072 工藤优作的推理秀
File.1060
Rum委托Vermouth调查可能对组织造成威胁的人物（即工藤优作）留在日本的原因。
工藤夫妇发现自己被黑衣组织所监视了，便和FBI计划，相反的进行了显眼的行动，想要看看对方的动作。
File.1058
Vermouth决定以假扮怪盗基德身份再假扮工藤优作并参与直播，以此潜入工藤家进行调查。
File.1060
工藤夫妇与赤井向柯南透露他们一起拟定的战略。
优作和赤井告诉柯南“组织要有大动作”。
1077-1079 黑衣组织的谋略
File.1061
黑衣组织从FBI接头地点的暗号杀害FBI搜查官，FBI暂时躲到工藤宅。
File.1062
柯南解开FBI接头地点的暗号，卡迈尔建议可以用此暗号引出组织。
赤井给一顶帽子卡迈尔，防止他的身份被组织成员认出。
Rum从接头地点的暗号得知FBI的战略，通知Gin一行人，令他们可以进行反击。
File.1063
卡迈尔被组织成员追逐，Kir打伤卡迈尔，连人带车冲向海中。
Korn对卡迈尔的面容有所熟悉，Gin决定去寻获卡迈尔。
File.1064
卡迈尔躲到海猿岛，赤井易容成冲矢，在优作的同意下带上柯南一起去营救卡迈尔。
Gin从海猿岛的火光得知卡迈尔的位置，在Rum的安排下登岛搜寻卡迈尔。
水无私下联络赤井关于组织的行动。
File.1065
Vodka提到Rum的特征是为了掩饰身份而放出的假情报，只有义眼的情报为准确，现在改变了长相，还起了个胡编乱造的名字。
File.1066
卡迈尔被Chanti击中落水后生还，回到工藤宅后回忆起Vodka所说的“Rum改变了长相，还起了个胡编乱造的名字”，引起赤井和柯南的注意。
Gin给Korn看卡迈尔的照片，Korn表示两年前Rum给他发的邮件照片中的人物就是他。
Rum在其劳斯莱斯车内与Gin通话时表示此次因行动过于引人注目而被那位先生斥责，并回想起两年前以老人身份暴露赤井为FBI的卡迈尔。
Rum伪装为胁田兼则，回到伊吕波寿司店，继续调查小五郎。
1085-1086 不吉利的结缘
File.1067
由于大量探员在日本殉职，FBI总部紧急宣布终止所有在日本探员的活动并立即召回。
1093-1094 宫野明美的时间胶囊
File.1070
若狭窃听柯南和灰原的对话，怀疑灰原的真正身份为宫野志保。
File.1072
胁田前往帝丹小学为第19届毕业生同学会送寿司，回店时想起宫野明美也是帝丹小学第19届毕业生，感慨“死人怎么可能来呢”。
若狭看到送完寿司走出校门的胁田时右手扶窗，做出类似“浅香”的动作。
1135-1136 大冈红叶的甜蜜陷阱
File.1090
黑田与伊织对话时称其为“榊原”（伊织多年前卧底时用的伪名）并多次提及日本公安暗语，同时一名戴有呼吸机的神秘老者乘老爷车经过，并慨叹警察“都是一些愚蠢之辈而已”。
1144-1145 酒店连环爆炸案件
File.1096
戴有呼吸机的神秘老者见到变小的玛丽后感慨“简直像是在做梦一样”。
1148-1149 侦探团与两位引领者
File.1097
若狭率少年侦探团前往静冈县参加假面超人联名活动，柯南为防止若狭试探灰原而邀请冲矢同去。
File.1098
若狭询问灰原药物知识从何学到，并表示灰原“简直像是某个地方的科学家一样”。
File.1099
若狭看到冲矢用截拳道与流氓团伙交战，回忆起多年前被赤井务武保护的情景。
柯南和冲矢留意到若狭右手上的伤痕。
1150-1151 怪盗基德与王冠魔术
File.1100
胁田回想起去帝丹小学送寿司的经历，向柯南询问若狭“有什么奇怪的地方”，柯南以“完全没问题，虽然有点笨手笨脚”回应。
胁田在看到基德的预告函后表态“去了也帮不上忙”，心想如果自己左眼还在的话“就另当别论了”。
File.1102
一个神秘老人在手机上看到柯南与次郎吉“死守皇冠”的报道后用自己的鹰头手杖敲碎手机屏幕。
1164-1167 17年前的真相
File.1103
小林、若狭带少年侦探团前去观看国际象棋大赛，胁田在侦探事务所对小五郎提到“国际象棋大赛”时露出微笑，想起17年前羽田浩司案的情景。
File.1104
柯南发现白鸟送给小林的骑士钥匙圈右侧脸上被沾有血迹的手抓过，身后的黑田由此想起阿曼达的遇害现场。
胁田以Rum的身份乘车前往案发现场。
File.1105
Rum通过自己的笔记本电脑入侵大堂监控后发现影像中的若狭，并将截图发给Chianti和Korn，声称要“疑罪从有”。
黑田将阿曼达遇害现场的照片拿给柯南看，在柯南询问羽田-阿曼达案的详细情况时表示“说来话长”。
File.1106
黑田向柯南讲述阿曼达的遇害经过。
若狭将小林的伞掰断后将自己的伞让给小林，并离开咖啡店，同时Chianti和Korn准备狙击。
File.1109
柯南解开阿曼达留下的暗号，黑田回想起自己17年前曾与一个拥有蛇一般眼睛的人擦肩而过。
Chianti和Korn因伞的图案将小林误认为若狭，准备狙击时被发现不对的Rum喝止，最终只击中伞柄。
若狭从附近枪械店抢到的枪击中Chianti的左肩，Rum下令二人撤退，同时思考通过APTX-4869恢复自己右眼能力的可能。
帝丹小学公开课事件
File.1110
柯南发现自己1毫米都没有长高，询问灰原是否与APTX-4869有关，灰原表示否认后却露出意味深长的表情。
File.1111
优作认为赤井早已察觉柯南的真实身份，并怀疑若狭定期在网上更新羽田案相关信息，通过对反复访问者的查询追踪到阿笠博士的电脑，从而锁定柯南，来到帝丹小学任教，更指出若狭也许是“为了目的不择手段的类型”。
File.1112
Rum派手下来到帝丹小学门口，准备狙击若狭，唯因校内无关人员过多而放弃。
Rum的手下表示若狭可能有很多虚假住址，Rum自己亦十分在意若狭狙击Chianti后仍留在帝丹小学的原因。
新干线劫持事件
File.1113
平次、和叶、红叶、伊织乘新干线前往东京途中，伊织看到右臂上的伤痕想起与红叶的过往。
一身份不明的人物将电话打给伊织，称其为公安警察，并表示自己的团伙杀害了其中一名乘客，红叶身后亦有人举起一把沾满鲜血的匕首。
File.1114
伊织认定犯人就是三年前从别墅逃跑的歹徒，并想起袭击前首相别墅的歹徒团伙与因丑闻而被前首相更换出内阁并开除党籍之鹤城议员的关联。
File.1115
一个持有鹰头手杖的老人要求某人调查江户川柯南的相关信息，通话由在新干线列车上发现手机的安室接听。